卵巢囊肿的治疗取决于患者的年龄、恶性、囊肿的位置、体积、大小、生长速度、生育功能和主观愿望。
1.良性卵巢囊肿的手术治疗
（1）卵巢囊肿切除术，年轻患者尤其是绝经前患者多采用此种术式，而尽可能保留正常的卵巢组织。
（2）输卵管卵巢切除术，年龄较大(45岁以上)或绝经后患者，可行一侧或双侧输卵管卵巢切除术。值得注意的是，大卵巢囊肿的手术治疗应完全切除，不考虑切口大小，以免破坏患者脉搏内容物溢入腹腔或切口。术中注意腹压快速变化引起的脉搏、呼吸、血压变化，必要时加速输液、输血、输氧。
2.恶性卵巢囊肿的手术治疗
（1）大多数患者已经到了晚期，所以他们应该尽最大努力切除原发囊肿和可见的盆腔和腹腔转移炉。由于卵巢恶性囊肿通常与子宫、附件粘连或渗透，并与盆腔腹膜紧密相连，子宫和肿瘤与盆腔腹膜的整个切除，如大网膜切除术、部分肠道切除术、部分膀胱和输尿管切除术。
(2)术后腹腔注射化疗药物可考虑在腹腔内留置导管。
