根据结石的大小、数量、位置和并发症，治疗方法不同，治疗费用也不同。此外，治疗总费用还包括检查费、手术费、麻醉费、药品费等。
药物治疗：对于小于6mm光滑的结石可以通过多喝水、吃排石药、运动等方式排出。药物大约需要5000种-1000元左右。
体外冲击波碎石治疗：直径不超过2cm体外冲击波碎石可用于肾结石。成本约为1万元-2000元左右。另外，振波可能需要两次才能有效排出。
目前，肾结石微创手术有三种常见的治疗方案：一种是输尿管镜砾石，第二种是经皮肾镜砾石，第三种是腹腔镜输尿管切开或肾盂切开。
输尿管镜碎石取石术：对于<2cm,透X输尿管软镜下的碎石可用于体外冲击波碎石困难的结石。成本为2万-250000元之间。<2cm,透X线，体外冲击波碎石困难的结石，可以选择输尿管软镜下的碎石。费用在20000-250000元之间。
经皮肾镜碎石取石术：对于2cm建议经皮肾镜碎石取石。目前治疗费用一般为2.5万-30000元左右。
腹腔镜输尿管或肾盂切开取石治疗：如果肾盏结石较多，肾功能不全或反复感染，可在腹腔镜输尿管或肾盂切开取出结石。成本一般为2万元-3万元左右。治疗不同的治疗方案，治疗价格也不同。
