(一)病因
病因不明。广泛的研究表明，遗传因素、免疫因素、感染因素、药物等都可能在其发病中发挥作用。
(二)发病机制
虽然这种疾病的确切发病机制尚不完全清楚，但已经发现了这种疾病和HLA-DR2和HLA-DR3与抗原有关，尤其是与抗原有关HLA-DRBl*0301等位基因和HLADQ*0501等位基因密切相关。HLA-B8抗原与女性患者密切相关，HLA-B7抗原和HLA-B8.42与盘状红斑有关；自身反应T细胞刺激自身反应性B细胞通过细胞分化和产生自身抗体Ⅲ型过敏反应（免疫复合物）对多系统和器官造成损害；病毒感染后，其基因组整合到宿主细胞的基因组中，基因变化可诱导宿主DNA抗体、感染细胞表面的病毒抗原会改变细胞膜，从而诱发这些感染细胞的体液免疫反应；药物和环境因素会损害身体结构，导致免疫反应和多器官损伤。
系统性红斑狼疮的免疫学特征是抑制性T细胞功能下降，多克隆B细胞激活、高免疫球蛋白血症和自身抗体形成。其自身抗体包括抗核抗体和单链抗体DNA抗体(抗ssDNA抗体)、抗双链DNA抗体或抗自然DNA抗体(抗-dsDNA抗体或抗nDNA抗体)和抗细胞成分的抗体。这些抗体通过血液循环沉积在各种器官和组织中，形成免疫复合物，激活补体系统，导致炎症反应和组织损伤。血管炎是其最初和最基本的病理和生理变化。
