中药灌肠疗法治疗结肠炎，可使药物直接到达病变部位，但也发挥局部清洗的作用，达到腹泻抗炎、痉挛、疼痛，改善局部血液循环和新陈代谢，增强肠道免疫功能，促进溃疡愈合的目的。具体药物及操作如下：
1、菊花30g，白术15g，防风10g，甘草10g，白芷8g，米壳15g。便血重时加防风炭，云南白药适量，溃疡广泛者加雷公藤6g。煎药后，用双层纱布过滤去渣，然后回锅浓缩至60～80ml，灌肠每晚保留一次药液，连续7次～10天为1个疗程。
2.黄芪、白术、丹参、白芍20g，黄连、黄芩、侧柏叶、防风15g，金银花、连翘、白及、生地10个g，每剂煎3次，每剂煎250ml，3次共750ml，其中，早餐前各服250ml，余下250ml晚上睡觉前用药液灌肠。
3、苦参30g，地榆15g，槐花15g。水煎浓缩至100～250ml，珍珠层粉6g溶于药液中，保留灌肠。若腹痛明显可加没药、莪术以行气活血，散瘀止痛；若大便次数增多，结肠水肿明显者，可加生苡仁利水消肿，健脾止泻，清热排脓。
生蒲黄10g，仙鹤草，败酱草，乳香15g，没药6g，煅龙骨10g先煎，生牡蛎10g先煎，红石脂10g先煎。将上药煎成2000。ml药液，每晚睡前灌肠，15天1个疗程。
5.将壁虎研末合白，煎成粘性汤，保留灌肠，每3天1次，5次为1个疗程。另外，将壁虎、白、半研粉放入胶囊中，每次2次～3粒，在灌肠间歇期服用，1个疗程后服用胶囊2周，其他西药可在治疗期间停用。中药灌肠应每晚睡觉前进行，灌肠前排空粪便，液体温度为36℃～39℃为宜。
