治疗再生障碍性贫血极其困难，预后差，预防本病的发生非常重要。对于继发性患者，关键是消除再生障碍的病因。
1.化学物质 化学物质，特别是药物，是导致再生障碍的最常见因素，因此必须注意合理用药。尽量避免使用氯霉素、解热镇痛药等。严格掌握对造血系统有害的药物的应用指标，防止滥用对造血系统有害的药物，并在使用过程中定期观察血象。避免接触苯等有害化学物质。
2.加强防护措施 接触损害造血系统毒物或放射性物质时，应加强各种防护措施。患者应尽量减少放射诊断和治疗次数，避免过度照射，并定期进行血象检查。
3.防治病毒感染 大力防治病毒性肝炎等病毒感染。病毒感染与再生障碍的发生密切相关，最常见的是肝炎病毒。再生障碍主要继发于非甲型和非乙型肝炎，与甲型肝炎无关。临床发现，部分再生障碍患者在发病前有感冒史，表明部分再生障碍可继发于普通感冒后。因此，加强体育锻炼，注意饮食卫生，保持舒适的情绪，工作和休息的结合，增强身体的抵抗力，防止感染继发性再生障碍。
