尖锐湿疣的发病主要是由性行为感染引起的。当然，尖锐湿疣作为一种性病，也很容易重复。反复复发的主要因素有两个。一是治疗不彻底，病毒没有完全杀灭，二是再次接触感染源。下面详细介绍一下这方面:
①患者细胞免疫功能异常：研究表明，肾移植后长期口服排斥药物和艾滋病患者尖锐湿疣的发病率显著增加，表明免疫功能缺陷患者，特别是细胞免疫功能异常患者，乳头瘤病毒感染的几率大大增加。
②尖锐湿疣的亚临床感染现象：由于人乳头瘤病毒的潜在感染，非皮损区域会产生新的临床和亚临床皮损。激光或冷冻治疗局部去除疣后，原皮损区域会发生新的皮损。
③患者雌激素水平高：聚合酶链反应研究表明，妊娠期雌激素受体尖锐湿疣组织的数量和强度高于非妊娠期尖锐湿疣组织，与妊娠期临床感染乳头瘤病毒生长速度和体积一致，表明雌激素与乳头瘤病毒活动有关，是尖锐湿疣的辅助因素之一。
虽然尖锐湿疣主要是性传播，但也可能是其他感染方式，相对罕见，如接触患者使用的物品，一般指生殖器接触病毒，属于间接感染行为，如公共厕所病毒感染，或公共浴巾等。
