生殖器疱疹主要是由感染引起的。最常见的感染方式是性行为，但也有其他感染方式，如接触生殖器疱疹病毒。此外，其他感染方式基本罕见。以下是生殖器疱疹的病因：
1、皮肤粘膜或受损部位感染。疱疹病毒大多通过皮肤粘膜或受损部位进入人体，复制在表皮或真皮细胞中，沿神经进入神经细胞。皮肤感染疱疹病毒到神经细胞发现病毒，大约2天，可以看出这是一种非常传染性的疾病。
2.生殖器与感染密切接触。生殖器疱疹主要由性行为传播和生殖器接触引起。患者血清学呈阳性，终身可有泌尿生殖道HSV间歇性活动。
3、神经节和与之接触的神经组织感染。在感染的初始阶段，病毒首先复制在神经节和相关的神经组织中，然后通过感觉神经到达皮肤和粘膜表面。
需要注意的一点是，虽说绝大多数情况下，性病都是由于性行为传染所致，但也有其他方面的传染途径，而做为生殖器疱疹的患者来说，对于自身所使用的物品等需要进行隔离处理，并且定期消毒。
