肾盂肾炎是由各种病原微生物感染直接引起的肾小管、肾间质和肾实质性炎症。有报道称，部分肾盂肾炎，特别是慢性病变和肾疤痕组织，部分病原体抗原成分，部分免疫复合物沉积，结合致病菌抗体包裹和淋巴细胞和单核细胞浸润，表明肾盂肾炎的发病机制有免疫反应性损伤。
病原体，-80％；)，其次是变形杆菌、葡萄球菌、粪链球菌、碱杆菌，少数为绿脓杆菌；偶尔是真菌、原虫、衣原体或病毒感染。
二、感染途径
1、向上感染：是肾盂肾炎的主要感染途径。正常情况下，尿道口及其周围有不同数量的病原体，但不致病，在某些原因（如身体抵抗力降低、尿流不良、性生活等），病原体可侵入并沿尿道，通过膀胱、输尿管侵入肾盂粘膜，然后通过肾灯、肾乳头到达肾本质和疾病。男女都可能发生，但由于女性尿道短而宽，女婴尿道口容易被粪便污染，老年妇女尿道口常有肉阜排尿不良，容易发生向上感染。
2.血液感染:病原体从肾外任何部位的感染灶通过血液循环传播到肾脏，导致肾盂肾炎，如疖子、痈、骨髓炎或败血症。
3、淋巴感染：下腹部和盆腔器官的淋巴管与肾脏的淋巴管有大部分交通支，结肠肝曲与肾脏有淋巴管沟通。当盆腔感染或结肠病变时，细菌可以沿淋巴感染肾脏。
4.阑尾脓肿、腹腔或盆腔脓肿等相邻组织感染直接蔓延，导致肾盂肾炎。
病理
在病理解剖粘膜充血、膨胀、表面脓性分泌物、粘膜下白细胞浸润、部分形成小脓肿。一个或多个肾乳头可以看到不同的大小，延伸到皮质楔形炎症病变，楔形尖端指向肾乳头。病变肾小管腔内有脓性分泌物，肾小管上皮细胞肿胀、坏死、脱落，大部分白细胞白细胞间质内形成小脓肿。炎症严重时，可发生广泛出血，肾小球一般无形态变化，但周围往往有不同程度的白细胞浸润。这些炎症性病变，小病变可以完全治愈，但大病变愈合后会留下疤痕。除上述肾盂外，慢性肾盂肾炎的病理变化。除了肾盂外，肾盂粘膜和肾实质性炎症，还有肾盂、肾盂粘膜和乳头疤痕的形成，以及疤痕收缩引起的肾盂肾盏变形、狭窄，肾实质上有明显的纤维增生，镜下有肾小管上皮萎缩、退化、管腔内渗出物，肾盂周围有不同程度的纤维增生和白细胞。
