由于胃平滑肌瘤和平滑肌瘤很难识别，而平滑肌瘤可能会发生恶性变化，因此应进行手术治疗。一般选择局部广泛切除术，边缘应至少距肿瘤边缘2～3cm以上。疑似恶变者应进行胃切除术或全胃切除术。
有蒂的肿瘤直径小于2cm可通过内镜切除；多发、无蒂、直径大于2cm腹腔镜下或剖腹手术应切除出血、梗阻等症状或内镜活检、细胞学检查疑似恶剖腹手术切除。
手术方法取决于病变的具体情况，直径小于5cm胃、胃窦、胃底平滑肌瘤，如果肿瘤边界清晰，肿瘤无坏死，肿瘤部位胃粘膜无溃疡，腹腔无转移炉，局部肿瘤切除，边缘距肿瘤1cm。当肿瘤直径小于3时，位于幽门或贲门的平滑肌瘤cm保守的局部切除术或与部分胃壁楔形切除术是可行的。较大的平滑肌瘤（直径）≥5cm），必须按照恶性肿瘤进行治疗，除非最终检查能够确定其真实性质。或者幽门、贲门肿瘤直径大于3cm，大部分远端或近端胃切除术切缘距肿瘤2～3cm。
