目前常用的龟头炎治疗方法有:消防诱因、局部用药、全身用药、中药熏洗。但龟头炎长期无法治愈，反复复发，甚至治愈越来越严重。主要原因有四个:
简单用药
对龟头炎没有引起足够的重视，比如有的患者难于启齿，随便到药店买些抑菌软膏或口服抗菌药，这对初始感染龟头炎时有效，但是忽视了很多抗真菌软膏并不能杀死病菌这一情况，便很快复发，每次复发都加重症状。
2.滥用药物
各种假广告号称“根治”、“一药治百病”误导患者。龟头炎可以临床治愈，尤其是发病初期。科学治疗的治愈率很高，但与根治是两个概念。一种药物治疗多种性病是不科学的，导致患者滥用医疗和药物，这不仅没有治愈疾病，而且加重了症状。
3.不系统治疗
导致龟头炎的致病菌，如白色念珠菌，具有很强的附着力和毒性。必须合治疗，彻底杀灭病菌，按疗程巩固治疗，才能达到临床治愈，减少复发或不复发。
4.不能综合治疗
要彻底治愈某些细菌感染引起的龟头炎，必须进行综合治疗。除药物治疗外，食用治疗、精神治疗和科学防治都非常重要。例如，在治疗过程中，消除酵母食品、头发、刺激性食品、天然有效的抗菌食品、加强体育锻炼、提高免疫力等。
