抗生素、热水浴和局部理疗可以消散轻度周脓肿，但大多数需要手术治疗。手术有两种方法.
手术治疗分为传统手术治疗和微创治疗.传统的手术主要治疗方法是清理肛周化脓组织。方法是局部麻醉后用手术刀切开化脓性皮肤，用刮齿刮脓，然后排出引流。如果刮不干净或引流不足，很容易导致伤口感染或脓肿复发，恢复缓慢，治疗逐渐取代.微创手术分为激光高温烧灼术和等离子微创消融术.目前，许多医院也推出了激光治疗，激光治疗相对彻底，治疗效果也得到肯定，但激光的原理是发射高温燃烧激光治疗，温度约为600°在治疗病变的同时，也会损害正常组织，恢复缓慢，容易引起新的肛周病.
